[생화학] Chap12. Lipids & Cell membrane

5시 반까지 포스팅하고 밥먹고 카공하러 가고싶어요

내일 7시엔 기상해야하니까 오늘 돌아와서 바로 자야할듯

 

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1. fatty acid naming : R chain name -e + (ene/diene) + onic acid

지방산은 cis형태만 존재한다. 이는 trans보다 구부러져서 주변 포화지방산 간 van-deer-waals 힘이 약하고 이로 녹는점이 낮다. 녹는점이 낮으면 환경 변화에 따른 유동성을 확보할 수 있다. 

 탄소 수가 적어도 사슬길이가 적고 > 겹치는 부분이 적어 녹는점이 낮다. 

 

2. lipid type

• phospho lipid : 지방산 + 백본+ 인산 +알코올 구성. 백본이 glyceral 이면 phosphoglyceride, spingosine이면 spingomyelin이다. spingomyelin은 아미노 알코올이 특징임.
• glyco-lipid : 스킨고신에서 유도된 아민기가 아실화되어 지방산과 연결된 것이다. 당의 잔기는 항상 세포 바깥쪽이다. 
• chloesterol : 스테로이드 바탕 4개의 고리를 가진 분자.

3. archaeal membrane vs eukaryotes (막지방질)

• ether linkage를 통한 glyceral backborn > 가수분해에 내성을 가지며
• R group have branch > oxidation에 내성을 가지고
• reverse stereochemistry of central glycerol

4. bilayer vs micell (인산지방질)

• 더 큰 사이즈라 세포 소기관이 자리하기 좋고
• self assembly process가 있어 소수성 상호작용을 한다
• 또한 넓게 퍼지고 닫히려는 경향이 있다.
• 협동성을 가지고 머리의 경우 h2o와 수소 결합을 한다
• 극성 이온 분자의 투과율이 낮은 이유는 소수성 환경과 친수성 환경에서의 용해도 차이에서 비롯되었다. 

5. 막단백질의 분류

• peripheral : 정전기적 상호작용을 해 bilayer의 머리 원자단과 수소결합을 한다.
• integral : hydrophobic한 lipid 탄화수소화 rxn을 해 지방질 사이에 낑겨있는 단백질. 일부분이 단단하게 결합해도 분류됨.
• alpha helix : hydrophobic한 reisdue가 연속적으로 있을 시 환깅가능
• beta sheet : phobic 과 philic이 번갈아 있을 때 beta sheet일 확률이 있다.
• hydropathy plot: 각 residue별 수화 될 때의 자유에너지 변화를 기록한 것. 즉 극성 척도를 나타냄. 절대적이지는 않다. 

6. 단백질 특성

• 상호작용하는 환경에 따라 아미노산 특성을 파악할 수 있다.
• integral protein residue는 규직적으로 배열된다. 백본과 수소결합한다.
• 막 내부 수소 결합 파괴는 물이 없어 에너지적으로 불리하다.

7. 측면확산(lateral diffusion)

: 단백질 마다 이동성은 다르나 fluid masic model에 따르면 bilayer lipids는 integral protein의 용매이다. 

 : flip-flop의 경우 시간이 오래 걸리는데 이는 막의 비대칭성을 강화한다.

 : 생체막 내외부는 항상 서로 다른 성분과 효소 활성을 가지기 때문이다. 비대칭성의 보전은 플립플랍이 거의 안일어나며 언제나 이미 존재하는 막의 성장으로부터 막이 합성되기 때문이다. 

 : 글리코실화 지방질의 경우 탄수화물이 친수성이기에 지방질과 상호작용시 불리해 플립플랍을 안한다.

 

막의 유동성

 : 동물은 콜레스테롤을 사용한다.

 : 박테리아는 그램네거티브의 경우 얇은 세포벽 + 2개의 생체막을 가진다. 즉 하나의 외부생체막이 존재. 포지티브는 굵은 세포벽과 하나의 생체막을 가짐.